19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4208 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  360  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  55.4 
 
 
164 aa  157  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  56.52 
 
 
164 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  41.67 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  52.42 
 
 
169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3431  hypothetical protein  42.35 
 
 
179 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3299  hypothetical protein  43.07 
 
 
184 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  27.5 
 
 
255 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  27.52 
 
 
169 aa  47.8  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  26.14 
 
 
256 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  23.86 
 
 
254 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  23.91 
 
 
266 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  27.42 
 
 
170 aa  44.3  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  23.86 
 
 
255 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  20.97 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  24.79 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16840  hypothetical protein  32.31 
 
 
176 aa  41.6  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  25.37 
 
 
310 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>