13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3952 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3952  VanZ family protein  100 
 
 		 122 aa  221  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5688  VanZ family protein  49 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1288  hypothetical protein  47 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.776572  normal  0.463218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20130  hypothetical protein  39.36 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0437  hypothetical protein  29.91 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3617  VanZ family protein  40.51 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2894  VanZ family protein  36.63 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000490392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0059  VanZ family protein  34.55 
 
 		 118 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.861846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0472  hypothetical protein  36.05 
 
 		 119 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0802  hypothetical protein  34.41 
 
 		 138 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0713  VanZ family protein  34.41 
 
 		 138 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3444  VanZ family protein  35.45 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000207226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3115  VanZ family protein  37.78 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>