24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3528 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3528    100 
 
 		 462 bp  916    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0703    96.94 
 
 		 249 bp  341  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0880    87.5 
 
 		 436 bp  79.8  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  100 
 
 		 806 bp  61.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 806 bp  61.9  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2024  putative transposase  96.97 
 
 		 213 bp  58  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  100 
 
 		 806 bp  58  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 806 bp  58  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  82.22 
 
 		 651 bp  52  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2897    90.48 
 
 		 832 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  90.48 
 
 		 833 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  90.48 
 
 		 833 bp  52  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2317  hypothetical protein  82.22 
 
 		 933 bp  52  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097002  normal  0.0149356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  82.22 
 
 		 891 bp  52  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  100 
 
 		 1680 bp  48.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  96.43 
 
 		 2319 bp  48.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  91.67 
 
 		 833 bp  48.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  96.3 
 
 		 806 bp  46.1  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1205    96.3 
 
 		 366 bp  46.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  93.55 
 
 		 813 bp  46.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  93.55 
 
 		 813 bp  46.1  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  93.55 
 
 		 824 bp  46.1  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 960 bp  46.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  91.43 
 
 		 483 bp  46.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>