196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3081 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3081  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  100 
 
 
349 aa  708    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.903709  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4597  putative dehydrogenase protein  65.85 
 
 
329 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4685  putative dehydrogenase protein  65.85 
 
 
329 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348286  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4980  putative dehydrogenase protein  65.85 
 
 
329 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7870  putative dehydrogenase protein  65.62 
 
 
318 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4087  putative dehydrogenase protein  60.43 
 
 
328 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3709  Luciferase-like monooxygenase  65.62 
 
 
325 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3722  putative dehydrogenase protein  64.09 
 
 
325 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0414555 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3224  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  58.28 
 
 
343 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000991835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5283  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  52.76 
 
 
326 aa  343  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1273  putative dehydrogenase protein  55.03 
 
 
320 aa  338  8e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5578  putative dehydrogenase protein  50.16 
 
 
321 aa  331  9e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1275  putative dehydrogenase protein  54.4 
 
 
320 aa  323  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1435  putative dehydrogenase protein  54.72 
 
 
320 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.46412  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2231  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  50.16 
 
 
321 aa  305  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6346  luciferase family protein  48.26 
 
 
343 aa  279  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310691  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4037  putative dehydrogenase protein  48.75 
 
 
323 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122035  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7147  Luciferase-like monooxygenase  47 
 
 
343 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.348721  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8019  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  43.17 
 
 
325 aa  272  6e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5026  Luciferase-like monooxygenase  44.34 
 
 
326 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.798611  normal  0.182445 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5600  dehydrogenase/flavin-dependent oxidoreductase protein  43.89 
 
 
321 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421173 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1861  Luciferase-like monooxygenase  41.82 
 
 
335 aa  247  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  42.07 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  41.16 
 
 
332 aa  235  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24120  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  41.03 
 
 
332 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1412  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.94 
 
 
333 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349284  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0208  Luciferase-like monooxygenase  38.91 
 
 
333 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1140  luciferase family protein  40.79 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3981  luciferase family protein  41.14 
 
 
329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0510411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1130  Luciferase-like monooxygenase  37.27 
 
 
332 aa  212  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.60398  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  38.91 
 
 
332 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  39.33 
 
 
329 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4853  Luciferase-like monooxygenase  40.75 
 
 
321 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00131867  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5308  Luciferase-like monooxygenase  36.5 
 
 
329 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406576  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3301  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.69 
 
 
318 aa  198  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1188  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  37.38 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  36.56 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1142  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.71 
 
 
318 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  40.19 
 
 
319 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0670  Luciferase-like monooxygenase  38.32 
 
 
318 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  35.83 
 
 
324 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  36.96 
 
 
321 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  36.76 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3201  luciferase-like protein  36.57 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1366  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  36.76 
 
 
321 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4855  luciferase-like protein  35.91 
 
 
341 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4944  luciferase family protein  35.91 
 
 
330 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5223  luciferase family protein  35.91 
 
 
330 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.018076 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0326  Luciferase-like monooxygenase  32.83 
 
 
325 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.969827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5802  putative dehydrogenase protein  33.85 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0108673  normal  0.233745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5098  Luciferase-like monooxygenase  34.28 
 
 
379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3215  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  35.63 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.912024  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1341  luciferase family protein  35.26 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.973005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1669  hypothetical protein  34.37 
 
 
321 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5448  luciferase family protein  35.14 
 
 
328 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0743  luciferase family protein  35.08 
 
 
320 aa  162  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  35.26 
 
 
336 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1586  luciferase family protein  34.06 
 
 
503 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.648959  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0420  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase  28.96 
 
 
342 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3680  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.04 
 
 
322 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1544  luciferase family protein  33.75 
 
 
320 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708084  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.47 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0382  luciferase-like monooxygenase  32.2 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4387  Luciferase-like, subgroup  31.98 
 
 
339 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.128943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4126  luciferase family protein  33.33 
 
 
334 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  31.82 
 
 
338 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4584  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  32.58 
 
 
321 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18990  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.15 
 
 
325 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.873493  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  31.72 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  31.72 
 
 
336 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2747  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  34.41 
 
 
321 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4148  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.94 
 
 
331 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0168027  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  31.94 
 
 
336 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  31.94 
 
 
336 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  31.94 
 
 
336 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2479  Luciferase-like monooxygenase  33.23 
 
 
331 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000324346  hitchhiker  0.00415555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  30.33 
 
 
338 aa  136  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  31.56 
 
 
336 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0280  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  39.13 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  32.52 
 
 
337 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4102  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  33.13 
 
 
331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  0.155147 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  31.04 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4111  F420-dependent oxidoreductase, G6PDH family  31.94 
 
 
342 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  27.52 
 
 
330 aa  123  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6790  luciferase family protein  32.8 
 
 
322 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  33.87 
 
 
360 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2078  hypothetical protein  47.37 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961644  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4906  luciferase family protein  32.52 
 
 
325 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.089783  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.36 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1720  Luciferase-like monooxygenase  30.69 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0815557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5617  luciferase-like protein  41.38 
 
 
323 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.0935751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  31.52 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2247  luciferase family protein  27 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1857  Luciferase-like monooxygenase  24 
 
 
287 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2867  putative F420-dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
311 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  25.17 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2346  luciferase family protein  25.74 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0184001 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0336  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  25.68 
 
 
264 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1200  alkanesulfonate monooxygenase  32.95 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.03 
 
 
311 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>