70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2840 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  65.14 
 
 		 331 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  71.76 
 
 		 381 aa  224  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  62.72 
 
 		 340 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  62.29 
 
 		 320 aa  218  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  64.74 
 
 		 344 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  62.94 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  66.47 
 
 		 406 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  63.74 
 
 		 336 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  63.74 
 
 		 336 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  63.74 
 
 		 336 aa  208  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  57.06 
 
 		 346 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  63.22 
 
 		 383 aa  195  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  56.71 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  55 
 
 		 375 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  52.78 
 
 		 516 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  52.22 
 
 		 520 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  43.29 
 
 		 336 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  41.38 
 
 		 332 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  42.07 
 
 		 336 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  40.23 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  41.51 
 
 		 335 aa  128  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  40.25 
 
 		 335 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  39.63 
 
 		 337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  40.24 
 
 		 337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  39.63 
 
 		 337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  40.88 
 
 		 335 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  40.88 
 
 		 335 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  39.63 
 
 		 337 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  41.14 
 
 		 349 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  40.24 
 
 		 337 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  40.25 
 
 		 335 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  39.62 
 
 		 336 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  40.25 
 
 		 335 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  39.63 
 
 		 336 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  39.63 
 
 		 337 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  38.41 
 
 		 337 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  37.27 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  39.02 
 
 		 337 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  35.4 
 
 		 331 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  36.02 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  38.01 
 
 		 336 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  38.01 
 
 		 336 aa  122  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  39.62 
 
 		 357 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  39.62 
 
 		 357 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  39.62 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  39.62 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  39.62 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  39.51 
 
 		 339 aa  122  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  39.62 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  39.62 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  37.8 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  35.4 
 
 		 331 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  37.8 
 
 		 384 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  37.8 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  39.05 
 
 		 355 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  38.36 
 
 		 336 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  37.74 
 
 		 335 aa  115  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  38.04 
 
 		 343 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  37.71 
 
 		 334 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  35.39 
 
 		 364 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  38.16 
 
 		 333 aa  101  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  32.93 
 
 		 814 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>