More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1933 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1933  Betaine-aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
509 aa  1023    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592937  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4544  Betaine-aldehyde dehydrogenase  64.43 
 
 
493 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10200  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  60.54 
 
 
493 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2160  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.97 
 
 
496 aa  545  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0116  Aldehyde Dehydrogenase  43.49 
 
 
503 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0137  betaine-aldehyde dehydrogenase  44.54 
 
 
503 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.313146  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4757  aldehyde dehydrogenase  44.33 
 
 
506 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3047  Aldehyde Dehydrogenase  40.37 
 
 
508 aa  355  1e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  40.42 
 
 
503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43.75 
 
 
496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4012  Aldehyde Dehydrogenase  40.91 
 
 
508 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  40.82 
 
 
490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.62 
 
 
490 aa  351  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  41.46 
 
 
473 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  40.62 
 
 
499 aa  350  3e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.02 
 
 
498 aa  349  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1838  Aldehyde Dehydrogenase  40.33 
 
 
494 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  40.33 
 
 
490 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  43.57 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3942  aldehyde dehydrogenase  39.55 
 
 
506 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1981  Aldehyde Dehydrogenase  39.83 
 
 
502 aa  340  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.823861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  40.83 
 
 
497 aa  339  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  39.5 
 
 
505 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0344  aldehyde dehydrogenase  39.55 
 
 
541 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2720  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.92 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133505  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  42.65 
 
 
494 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2913  aldehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.34 
 
 
494 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4941  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
498 aa  335  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
492 aa  335  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2233  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.66 
 
 
788 aa  335  9e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635265  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  39.34 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1164  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.04 
 
 
512 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4211  aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
497 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.286513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3463  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
497 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.506857  normal  0.23094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  40.63 
 
 
497 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4372  aldehyde dehydrogenase  39.88 
 
 
483 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330214  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1004  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.59 
 
 
492 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.92 
 
 
494 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4697  aldehyde dehydrogenase  39.92 
 
 
496 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.754003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  41.02 
 
 
510 aa  333  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  38.55 
 
 
492 aa  333  5e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0158  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
495 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0153  aldehyde dehydrogenase  37.89 
 
 
495 aa  333  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.43 
 
 
490 aa  333  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
501 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3867  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 
488 aa  331  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.587475  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.91 
 
 
501 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0338  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate semialdehyde dehydrogenase  43.03 
 
 
513 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  39.34 
 
 
494 aa  331  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0085  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  41.19 
 
 
493 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0985  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.18 
 
 
499 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
497 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7306  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.82 
 
 
496 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13620  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.99 
 
 
497 aa  329  6e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3159  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
484 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1036  aldehyde dehydrogenase  42.12 
 
 
494 aa  329  9e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70950  betaine aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
490 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.934353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6158  betaine aldehyde dehydrogenase  39.09 
 
 
490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0269  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.33 
 
 
506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2872  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40 
 
 
506 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4480  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
506 aa  327  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2254  aldehyde dehydrogenase  40.49 
 
 
506 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2946  aldehyde dehydrogenase  40.24 
 
 
497 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.264552 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2539  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 
506 aa  326  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5228  aldehyde dehydrogenase  41.49 
 
 
501 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.441186  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0252  Aldehyde Dehydrogenase  38.75 
 
 
506 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000571584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0249  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
506 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000168976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3772  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
506 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0250  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
506 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000231621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38.64 
 
 
488 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1759  aldehyde dehydrogenase B  37.32 
 
 
486 aa  324  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1054  Aldehyde Dehydrogenase  42.51 
 
 
513 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
483 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3815  aldehyde dehydrogenase  40.82 
 
 
501 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.397992 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02420  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
506 aa  324  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0251  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
506 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5650  aldehyde dehydrogenase  40 
 
 
507 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.260352  hitchhiker  0.00474068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1414  aldehyde dehydrogenase  37.91 
 
 
506 aa  324  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2339  aldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
506 aa  324  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0248  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
506 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0248  aldehyde dehydrogenase  38.75 
 
 
506 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1366  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  40.62 
 
 
511 aa  323  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3281  aldehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
505 aa  323  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1192  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
508 aa  323  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3410  aldehyde dehydrogenase  39.16 
 
 
506 aa  323  4e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0364  aldehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
506 aa  323  5e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.601797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3311  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
501 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5056  aldehyde dehydrogenase  41.29 
 
 
501 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2837  Aldehyde Dehydrogenase  36.8 
 
 
502 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 
488 aa  323  7e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.01 
 
 
488 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1326  elongation factor P (EF-P)  38.16 
 
 
491 aa  322  8e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>