36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1457 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1457  PilT protein domain protein  100 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.739604  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0121  PilT protein domain protein  40 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3791  PilT domain-containing protein  36.5 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0127598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4717  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 131 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.603511 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4194  PilT domain-containing protein  35.77 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2636  PilT protein-like  34.59 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4269  PilT protein, N-terminal  32.85 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.692119  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3315  PilT protein domain protein  33.07 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.424666  normal  0.500122 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2220  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31850  PIN domain family protein  32 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3439  PilT protein domain protein  31.5 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00629  PilT protein domain protein  28.46 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000365497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4379  PilT protein domain protein  35.29 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1949  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0465  PilT domain-containing protein  29.85 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0690648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1408  PilT protein domain protein  26.28 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.748056  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0789  PilT domain-containing protein  33.59 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6299  PilT protein-like  31.78 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2968  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.691799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2947  PilT domain-containing protein  31.3 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2333  PilT protein-like  31.3 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2032  PilT domain-containing protein  33.09 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1038  PilT domain-containing protein  31.78 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.442383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12844  hypothetical protein  33.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000370352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4037  PilT domain-containing protein  28.57 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3737  PilT domain-containing protein  27.27 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2909  PilT protein domain protein  31.97 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4684  hypothetical protein  28.47 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319794  normal  0.0555217 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0660  hypothetical protein  29.13 
 
 		 129 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246636  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0671  PilT domain-containing protein  26.81 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0593  PilT protein, N-terminal  34.92 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1565  PilT domain-containing protein  30.08 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1720  PilT protein domain protein  28.24 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6344  PilT protein, N-terminal  30.16 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000192359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0047  PilT protein domain protein  28.99 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3687  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 128 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>