70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0195 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0195  allantoicase  100 
 
 		 383 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5936  allantoicase  62.12 
 
 		 331 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2589  allantoicase  57.63 
 
 		 381 aa  358  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4026  allantoicase  56.66 
 
 		 344 aa  342  8e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5167  allantoicase  57.59 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4867  allantoicase  57.59 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4781  allantoicase  57.59 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489226  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2779  Allantoicase  58.01 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0935  allantoicase  58.52 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4857  Allantoicase  55.1 
 
 		 406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.152506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2551  allantoicase  54.98 
 
 		 340 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00391688  normal  0.383399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  51.21 
 
 		 516 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  48.94 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0715  allantoicase  49.85 
 
 		 375 aa  305  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4725  allantoicase  49.12 
 
 		 346 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0172758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0236  allantoicase  46.84 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0614  allantoicase  43.96 
 
 		 335 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1876  allantoicase  44.04 
 
 		 337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.667162  normal  0.0784409 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0542  allantoicase  43.96 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830654  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1949  allantoicase  43.73 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0164  allantoicase  43.65 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0647  allantoicase  43.65 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6116  allantoicase  43.43 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1961  allantoicase  43.43 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1985  allantoicase  43.43 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55948 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5276  allantoicase  43.43 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0422431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0568  allantoicase  43.34 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1309  allantoicase  43.12 
 
 		 337 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.017957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3733  allantoicase  43.34 
 
 		 335 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3387  allantoicase  43.61 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0569  allantoicase  43.48 
 
 		 336 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2386  allantoicase  42.14 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2430  allantoicase  42.14 
 
 		 384 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3305  allantoicase  42.14 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401958  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1505  allantoicase  42.14 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.59781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2005  allantoicase  42.14 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1277  allantoicase  42.14 
 
 		 337 aa  236  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.593603  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2531  allantoicase  42.14 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0338515  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2595  allantoicase  43.96 
 
 		 336 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000409721 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2069  allantoicase  42.31 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3472  allantoicase  43.17 
 
 		 336 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.757583  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3274  allantoicase  43.65 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2739  allantoicase  41.49 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2327  allantoicase  41.28 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.877765  normal  0.393654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3145  allantoicase  42.86 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1298  allantoicase  40.67 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1342  allantoicase  42.38 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0206885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1928  allantoicase  40.98 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1204  allantoicase  42.06 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3422  allantoicase  41.93 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44850  allantoicase  42.68 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.195211 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3459  allantoicase  41.93 
 
 		 336 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3457  allantoicase  41.93 
 
 		 357 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21110  allantoicase  42.19 
 
 		 333 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.871688  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0378  allantoicase  41.61 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2460  allantoicase  41.61 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1237  allantoicase  41.61 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2648  allantoicase  41.61 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3820  allantoicase  42.37 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2840  Allantoicase  63.22 
 
 		 222 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1704  allantoicase  38.89 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.935214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4868  allantoicase  37.54 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1807  allantoicase  39.2 
 
 		 331 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3668  allantoicase  38.27 
 
 		 331 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2651  allantoicase  37.74 
 
 		 334 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1323  allantoicase  37.92 
 
 		 343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55822  allantoinase  33.65 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00849553  hitchhiker  0.00710217 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_3787  predicted protein  33.63 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03104  allantoicase, expressed, purine use (Eurofung)  34.88 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02340  allantoicase, putative  31.01 
 
 		 814 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.649401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>