More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3133 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  100 
 
 
269 aa  527  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  71.27 
 
 
270 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  70.63 
 
 
269 aa  362  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  70.79 
 
 
271 aa  355  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  69.66 
 
 
271 aa  348  6e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  59.85 
 
 
273 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  60.08 
 
 
272 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  46.01 
 
 
279 aa  228  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  51.15 
 
 
261 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.07 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  48.3 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.07 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.94 
 
 
266 aa  210  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  46.61 
 
 
266 aa  208  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.94 
 
 
266 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.49 
 
 
266 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
266 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  40.38 
 
 
265 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  43.24 
 
 
264 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  45.28 
 
 
261 aa  205  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
267 aa  204  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
266 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
266 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.71 
 
 
266 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 
266 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.08 
 
 
265 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.53 
 
 
265 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.07 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  42.42 
 
 
258 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.38 
 
 
267 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  42.16 
 
 
267 aa  198  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.86 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.95 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.95 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.95 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.95 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.68 
 
 
266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.95 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.38 
 
 
266 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  44.27 
 
 
272 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.87 
 
 
266 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.01 
 
 
264 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  42.35 
 
 
302 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  44.53 
 
 
272 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  43.87 
 
 
285 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  43.91 
 
 
267 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.04 
 
 
267 aa  185  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  40.81 
 
 
274 aa  185  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.01 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  42.25 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  41.67 
 
 
277 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 
282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  42.64 
 
 
273 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
272 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  38.66 
 
 
320 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.88 
 
 
282 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0116  Bacitracin resistance protein BacA  38.1 
 
 
293 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
286 aa  175  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  39.57 
 
 
289 aa  175  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.65 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.34 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  40.54 
 
 
272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  39 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.63 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.7 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.54 
 
 
280 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.43 
 
 
283 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  36.9 
 
 
386 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
292 aa  170  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  39.34 
 
 
302 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  38.38 
 
 
281 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
276 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  40.62 
 
 
290 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
282 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
276 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
259 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.41 
 
 
282 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  40.3 
 
 
290 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2440  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
259 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  39.18 
 
 
322 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2717  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
259 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000013117 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
259 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  39.18 
 
 
322 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.3 
 
 
287 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  40.59 
 
 
300 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
259 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2732  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
259 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1266  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.38 
 
 
260 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.58 
 
 
286 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.24 
 
 
292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2586  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0713308 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2479  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000149761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.58 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>