13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1963 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1963  putative signal peptide protein  100 
 
 		 299 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.789583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3206  putative signal peptide protein  35.47 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.987055  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4156  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1368 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369089  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2275  putative signal peptide protein  31.23 
 
 		 1332 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.747058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0017  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1249 aa  73.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0303219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2080  Tetratricopeptide TPR_4  26.88 
 
 		 1343 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5289  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1306 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0796191  normal  0.247502 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1492  putative signal peptide protein, TPR domain-containing  27.49 
 
 		 1327 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1042  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1345 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2974  signal peptide protein  34.4 
 
 		 1332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24490  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1193 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0772  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 		 1296 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.939745  normal  0.176155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2074  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1193 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>