21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1834 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1834  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.434531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2143  hypothetical protein  43.24 
 
 		 344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0705369  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2157  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 359 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2059  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.9 
 
 		 360 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1782  hypothetical protein  39.39 
 
 		 144 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.92731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0755  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 421 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 		 1402 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  47.46 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3476  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 634 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  0.161614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1213  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  25.62 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2282  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.88 
 
 		 433 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.883499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 1067 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1755  Flp pilus assembly protein TadD  31.13 
 
 		 321 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2193  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 		 426 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1149  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.15 
 
 		 265 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588418  normal  0.518826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2038  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 		 426 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.46 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1057  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.15 
 
 		 265 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0988004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2211  TPR domain protein  27.27 
 
 		 891 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06184e-33 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 597 aa  42.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1987  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 891 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>