24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1329 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1329  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  934    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2778  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
327 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0491  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 
867 aa  150  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2577  hypothetical protein  33.46 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3985  hypothetical protein  33.96 
 
 
527 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  29.23 
 
 
856 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
3301 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0517  hypothetical protein  35.04 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5781  glycosyl transferase, group 1  31.97 
 
 
373 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.820711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0150  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 
316 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240028  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1704  hypothetical Glycosyltransferase  29.17 
 
 
689 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.663936  hitchhiker  0.0000000000000460309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3527  hypothetical Glycosyltransferase  28.33 
 
 
689 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2581  hypothetical protein  23.99 
 
 
335 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.399589 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3366  hypothetical protein  28.29 
 
 
351 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0423  hypothetical protein  21.54 
 
 
323 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.607873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0934  hypothetical protein  25.9 
 
 
573 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
1562 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  23.92 
 
 
916 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1551  hypothetical protein  27.75 
 
 
329 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983382  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2780  hypothetical protein  23.36 
 
 
317 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0250  hypothetical protein  24.9 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1771  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0716326  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0673  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 
327 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.353586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0910  methyltransferase FkbM family  26.85 
 
 
1364 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>