16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0623 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0623  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  246  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0710  hypothetical protein  55.56 
 
 
128 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0936  hypothetical protein  55.21 
 
 
117 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.9998e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0134  hypothetical protein  50.98 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0360985  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1944  hypothetical protein  66.67 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310153  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1710  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6228  hypothetical protein  42 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.449021  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1931  hypothetical protein  59.26 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1182  hypothetical protein  36.89 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2109  hypothetical protein  37.76 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0754  hypothetical protein  53.57 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4193  hypothetical protein  35.79 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4298  hypothetical protein  48.98 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.827908  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3647  hypothetical protein  44 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1215  hypothetical protein  42.03 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.763477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1928  hypothetical protein  44.9 
 
 
133 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>