106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0656 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.127003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  97.5 
 
 		 408 aa  157  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  61.25 
 
 		 406 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  61.25 
 
 		 406 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  56.25 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2190  TRm3 transposase  53.75 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.992374  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  53.75 
 
 		 407 aa  77  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  55 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  55 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1379  transposase, mutator type  55 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  51.25 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  51.25 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  52.5 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  51.25 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  51.25 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  51.25 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2796  transposase, mutator type  52.5 
 
 		 366 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520079  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6034  transposase mutator type  55.88 
 
 		 400 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0363265  normal  0.408755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2349  transposase mutator family protein  45.45 
 
 		 252 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0271  transposase mutator family protein  45.45 
 
 		 422 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1082  transposase mutator family protein  45.45 
 
 		 422 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0319318  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2892  transposase mutator family protein  45.45 
 
 		 422 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1528  transposase mutator family protein  45.45 
 
 		 422 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.163505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3138  transposase mutator family protein  45.45 
 
 		 422 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.66274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2348  transposase mutator family protein  44.16 
 
 		 422 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3244  transposase mutator family protein  44.16 
 
 		 422 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.625679  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0292  putative transposase, mutator type  41.56 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0007  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0089  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0255  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0720  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216231  normal  0.208766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1272  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.437771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3142  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.394881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3172  transposase mutator type  42.31 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0027  ISMca5, transposase  40.79 
 
 		 411 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1219  ISMca5, transposase  40.79 
 
 		 411 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0428861  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  45.12 
 
 		 419 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  45.12 
 
 		 419 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  45.12 
 
 		 419 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  45.12 
 
 		 419 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0252  ISRSO7-transposase protein  41.03 
 
 		 416 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0478  ISRSO7-transposase protein  41.03 
 
 		 416 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4528  transposase mutator family protein  42.31 
 
 		 416 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1812  transposase mutator type  41.03 
 
 		 416 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.39638 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5785  transposase mutator type  41.03 
 
 		 416 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4451  transposase mutator type  41.03 
 
 		 416 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4860  hypothetical protein  37.74 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  57.78 
 
 		 375 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0700  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4611  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1179  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3752  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0480  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.690571  normal  0.698094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1262  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050865  normal  0.0250992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1503  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00430758  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2268  transposase, mutator type  40.96 
 
 		 416 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3783  transposase, mutator type  38.55 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000372197  decreased coverage  0.000919258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3315  transposase mutator type  45 
 
 		 415 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  40 
 
 		 411 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2305  transposase mutator type  38.27 
 
 		 425 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.505688 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6124  transposase mutator type  37.5 
 
 		 426 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6788  transposase mutator type  37.5 
 
 		 426 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3187  transposase mutator type  37.5 
 
 		 426 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0782  transposase mutator type  37.04 
 
 		 425 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  0.382155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1574  transposase mutator type  37.04 
 
 		 425 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2859  transposase mutator type  37.04 
 
 		 425 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3417  transposase mutator type  37.04 
 
 		 425 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257312  normal  0.128425 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1218  transposase, mutator type  33.33 
 
 		 411 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2050  transposase mutator type  41.89 
 
 		 459 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0245972  decreased coverage  0.002439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2044  transposase mutator type  41.89 
 
 		 459 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0327519  hitchhiker  0.00538259 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0077  IS1414, transposase, truncation  41.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.829264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3667  transposase mutator type  37.21 
 
 		 427 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0491111  normal  0.134883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2914  transposase mutator type  39.08 
 
 		 415 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3764  hypothetical protein  40.79 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3629  transposase mutator type  43.24 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00281606  decreased coverage  0.00170148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3472  transposase mutator type  43.24 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00565212  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4943  transposase mutator type  43.24 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0426  transposase mutator type  43.24 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1455  transposase mutator type  43.24 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.451123  normal  0.366718 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0005  IS1414, transposase  49.09 
 
 		 402 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0682409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0398  transposase, mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1201  transposase, mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1204  transposase, mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5297  transposase, mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1683  transposase, mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5562  transposase, mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3772  transposase mutator type  37.68 
 
 		 419 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0358  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0431  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.72525  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0926  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1103  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109528  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2748  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3131  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3279  transposase mutator family protein  37.68 
 
 		 396 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4726  transposase mutator type  39.13 
 
 		 419 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.685507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2656  transposase, mutator type  47.3 
 
 		 451 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3425  transposase, mutator type  47.3 
 
 		 451 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0177952  normal  0.280372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2225  transposase  38.36 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.217285  hitchhiker  0.00000000170643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5974  transposase, mutator type  43.64 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2050  transposase, mutator type  33.82 
 
 		 399 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>