21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0442 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  100 
 
 		 308 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1508  hypothetical protein  36.17 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1727  hypothetical protein  28.46 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0294059  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  29.15 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  41.77 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0904  sporulation related  34.85 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  39.73 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  35.14 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  32.91 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  32.14 
 
 		 463 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  30.77 
 
 		 498 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.33 
 
 		 1888 aa  50.4  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  35.46 
 
 		 474 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  33.75 
 
 		 467 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  25.74 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2257  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.56 
 
 		 503 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.53676  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  30.77 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  30 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  32.5 
 
 		 1108 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  30.86 
 
 		 1079 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  31.33 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>