More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0419 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0419  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 453 aa  925    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0310723 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1404  cysteinyl-tRNA synthetase  63.33 
 
 		 449 aa  558  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0689  cysteinyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 459 aa  512  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1903  cysteinyl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00355  cysteinyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4717  cysteinyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1100  cysteinyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0132034 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1153  cysteinyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.102155  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1915  cysteinyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2665  cysteinyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2731  cysteinyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 458 aa  441  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508946  normal  0.0729596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3498  cysteinyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 472 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0135  cysteinyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 449 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0281  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1638  cysteinyl-tRNA synthetase  52.92 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2661  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0311  cysteinyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0676  cysteinyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 474 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.02633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2071  cysteinyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 486 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.377072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 490 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 459 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 461 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4529  cysteinyl-tRNA synthetase  49.45 
 
 		 462 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0386515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0459  cysteinyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 460 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0171748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 459 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5571  cysteinyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1380  cysteinyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 486 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.194262  normal  0.461821 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1881  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0768  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.202696  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  50.88 
 
 		 455 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1488  cysteinyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 482 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 459 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2184  cysteinyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 461 aa  425  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5212  cysteinyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.253411 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0308  cysteinyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1166  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193068  normal  0.0129624 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 		 459 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01977  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 463 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2208  cysteinyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 459 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4745  cysteinyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  47.06 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 454 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0919  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 456 aa  408  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  47.22 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 456 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  49.35 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5285  cysteinyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.693404  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3374  cysteinyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 493 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301866  normal  0.0269367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0448  cysteinyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.680985  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1228  cysteinyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 477 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0965  cysteinyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.910557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>