27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_R0045 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_R0045  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.687091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0030  tRNA-Leu  97.37 
 
 		 77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0042  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140875  normal  0.0159157 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0026  tRNA-Leu  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0023  tRNA-Leu  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0022  tRNA-Leu  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0265779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0023  tRNA-Leu  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320575  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14020  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.579057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26000  tRNA-Leu  90.79 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0065  tRNA-Leu  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0037  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292769  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0021  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.729183  normal  0.627845 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0037  tRNA-Leu  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1377  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0040  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14017  tRNA-Leu  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.285332  normal  0.0623737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0025  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0040  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0045  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0043  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0041  tRNA-Leu  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0023  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000369375 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0019  tRNA-Leu  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000000251522  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0052  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28960  tRNA-Leu  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0025  tRNA-Leu  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0115082  normal  0.081764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0024  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.304311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>