41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4432 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4432  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0665  hypothetical protein  52.45 
 
 		 154 aa  150  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0644  hypothetical protein  54.29 
 
 		 185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.822743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0490  hypothetical protein  45.03 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00660  hypothetical protein  45 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0702  hypothetical protein  42.33 
 
 		 295 aa  107  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1749  hypothetical protein  40.82 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4334  hypothetical protein  40.99 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0767  hypothetical protein  43.57 
 
 		 321 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2789  hypothetical protein  38.93 
 
 		 300 aa  99.4  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4021  hypothetical protein  45.83 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.143522  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1734  hypothetical protein  40.82 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313917 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2912  hypothetical protein  40.82 
 
 		 238 aa  97.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.0809036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2509  hypothetical protein  38.62 
 
 		 328 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7163  hypothetical protein  37.25 
 
 		 216 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1160  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582536  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5256  hypothetical protein  39.22 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06480  hypothetical protein  39.86 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3984  hypothetical protein  40.62 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3998  hypothetical protein  40.62 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.234292 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4058  hypothetical protein  40.62 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3166  hypothetical protein  36.69 
 
 		 208 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.861461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2211  hypothetical protein  37.42 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.451727  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1196  hypothetical protein  40.82 
 
 		 170 aa  89  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289574  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11259  hypothetical protein  38.22 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139223 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19360  hypothetical protein  41.96 
 
 		 226 aa  87.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.494262  normal  0.0151138 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27820  hypothetical protein  37.41 
 
 		 257 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4485  hypothetical protein  40.26 
 
 		 186 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0190167  normal  0.0355281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0806  hypothetical protein  34.64 
 
 		 179 aa  84.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2482  hypothetical protein  35.85 
 
 		 205 aa  84  8e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.012965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2161  hypothetical protein  38.78 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.094331  hitchhiker  0.00123485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1865  hypothetical protein  36.91 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23860  hypothetical protein  34.29 
 
 		 340 aa  82  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1678  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000541332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09530  hypothetical protein  35.54 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1264  hypothetical protein  36 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15320  hypothetical protein  29.17 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0827  transmembrane protein  35 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0202  hypothetical protein  36.61 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4936  signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  29.09 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272462 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0140  hypothetical protein  30.23 
 
 		 257 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>