26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4297 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4297  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1041  hypothetical protein  56.84 
 
 
338 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4851  hypothetical protein  58.18 
 
 
343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.868118  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4939  hypothetical protein  58.18 
 
 
343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.660356  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5218  hypothetical protein  58.18 
 
 
343 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5789  hypothetical protein  55.73 
 
 
336 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.856799  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11420  hypothetical protein  51.49 
 
 
362 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2309  hypothetical protein  53.85 
 
 
338 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00941536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3358  hypothetical protein  51.41 
 
 
337 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2449  hypothetical protein  50.78 
 
 
356 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000884224  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3469  hypothetical protein  50.96 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6635  hypothetical protein  46.15 
 
 
337 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2070  hypothetical protein  44.18 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3393  hypothetical protein  43.03 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13100  hypothetical protein  41.11 
 
 
360 aa  218  8.999999999999998e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2109  hypothetical protein  41.77 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3964  hypothetical protein  40.81 
 
 
322 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0643  hypothetical protein  41.08 
 
 
356 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3588  hypothetical protein  41.46 
 
 
351 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0465  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.399016  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18920  hypothetical protein  34.51 
 
 
299 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.620455  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0071  hypothetical protein  21.84 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3487  hypothetical protein  24.15 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2434  hypothetical protein  24.16 
 
 
464 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3925  hypothetical protein  24.52 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4621  hypothetical protein  24.29 
 
 
368 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220381 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>