103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3386 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  100 
 
 
106 aa  216  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21830  growth inhibitor  52 
 
 
110 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000000451152  normal  0.350233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.61 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.64 
 
 
116 aa  67.4  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.79 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.51 
 
 
115 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.26 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.1 
 
 
118 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.94 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.71 
 
 
112 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.42 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12680  growth inhibitor  34 
 
 
124 aa  57  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02627  toxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system, endoribonuclease  36.84 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000370759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.84 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  29.63 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.37 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  36.84 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2920  toxin ChpA  36.84 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000686349  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4042  toxin ChpA  36.84 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000388483  normal  0.446754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  36.84 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.68 
 
 
123 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  29.63 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3086  toxin ChpA  36.84 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0930  toxin ChpA  36.84 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000206991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2335  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.93 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  28.7 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3091  toxin ChpA  36.84 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00144272  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.19 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.31 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.1 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
116 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1021  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.59 
 
 
115 aa  52  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000310459  unclonable  0.00000000357935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.25 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  36.45 
 
 
118 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  31.48 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  31.48 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.88 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  27.88 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  31.48 
 
 
116 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
116 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.26 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1099  ChpA protein  41.82 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0963556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  25.49 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0265  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.59 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36390  PemK-like protein  33.64 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  29.41 
 
 
112 aa  48.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.69 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.69 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2539  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.98 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.1 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.18 
 
 
170 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1937  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.74 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3898  toxin ChpA  32 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363948  normal  0.172464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.98 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0429  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1107  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.86 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.13 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  25.47 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  25.93 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.81 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.12 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.78 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1071  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.25 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  26.92 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2067  toxin ChpA  36.21 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1017  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.62 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5408  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.82 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414606  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01482  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.33 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4159  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.04 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.445345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4624  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.82 
 
 
116 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  30.56 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.18 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12023  hypothetical protein  28.97 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  43.75 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.47 
 
 
109 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4224  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.12 
 
 
120 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3061  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.28 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0295  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.72 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.021419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.45 
 
 
106 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0676  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.97 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91371  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  27 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.36 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>