127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0256 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0256  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 
124 aa  252  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0212  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  70.27 
 
 
116 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.200733  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1093  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  70.27 
 
 
116 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0232  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  68.47 
 
 
116 aa  167  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0269  transcriptional regulator, PemK family  68.47 
 
 
116 aa  167  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.76825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5056  transcriptional regulator, PemK family  68.47 
 
 
116 aa  167  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.213232  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0274  PemK family transcriptional regulator  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0240  PemK family transcriptional regulator  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0226  pemK-like protein  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0228  pemK-like protein  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0254  PemK family transcriptional regulator  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.725358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0240  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0288  transcriptional regulator, PemK family  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0266  transcriptional regulator, PemK family  68.47 
 
 
116 aa  166  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0966  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  66.67 
 
 
116 aa  165  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0359  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  67.57 
 
 
116 aa  164  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0286  PemK family protein  62.07 
 
 
117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2699  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  66.67 
 
 
116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0038479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0291  PemK family protein  61.21 
 
 
117 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0309  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  65.77 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2924  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  66.96 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.13253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2894  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  63.39 
 
 
116 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.219474  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1901  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.5 
 
 
147 aa  157  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00690873  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1879  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  66.67 
 
 
115 aa  156  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2105  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  63.72 
 
 
120 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2143  PemK family protein  63.72 
 
 
120 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  61.61 
 
 
116 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000815798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.5 
 
 
133 aa  153  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000297621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3743  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  61.26 
 
 
116 aa  154  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000296135  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1681  PemK family transcriptional regulator  61.34 
 
 
120 aa  152  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0974  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  58.93 
 
 
116 aa  151  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.836231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01740  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.16 
 
 
116 aa  150  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2165  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  62.16 
 
 
116 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000312533  decreased coverage  0.0000125897 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1640  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  60.17 
 
 
118 aa  138  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0998854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2436  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  53.85 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1811  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  61.95 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0166728  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2715  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.48 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0883325 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4955  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.46 
 
 
118 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2716  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.14 
 
 
111 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1568  PemK-like protein  40.57 
 
 
112 aa  84.3  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1831  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  40.18 
 
 
118 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1424  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.86 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905577  normal  0.0149694 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1380  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  39.81 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0962  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.83 
 
 
170 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1348  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.96 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.930315  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4547  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.59 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.653702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1718  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.4 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341117  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0346  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.37 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3399  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.96 
 
 
117 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398521  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12023  hypothetical protein  36.79 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.14 
 
 
114 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1194  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.24 
 
 
107 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0745  growth inhibitor, PemK-like protein  35.85 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0821  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.44 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2503  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.63 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0118079  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.2 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2646  MazE/toxin transcriptional modulator MazF  36.61 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1185  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.24 
 
 
106 aa  63.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3432  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.54 
 
 
107 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.328509  normal  0.0986406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3378  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.92 
 
 
109 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1876  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.67 
 
 
109 aa  60.5  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1483  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.82 
 
 
118 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1971  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.21 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1327  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  44.62 
 
 
72 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1191  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  34.41 
 
 
118 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.325689  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0024  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  37.86 
 
 
107 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2247  PemK family protein  31.43 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.191111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1144  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.9 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0572  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  41.67 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1228  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.4 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1199  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.4 
 
 
114 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7291  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1707  toxin-antitoxin addiction module toxin component MazF (an endoRNAse)  29.41 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000119812 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5889  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.46 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000397508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2435  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.03 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.250291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12814  hypothetical protein  29.31 
 
 
118 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000412903  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3386  PemK family protein  30.39 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2003  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.39 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5455  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  33.33 
 
 
107 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724766  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2564  PemK family protein  29.81 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0832  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.17 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.737175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1319  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  36.11 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00212253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3202  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.57 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11525  hypothetical protein  30.28 
 
 
105 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0925304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0630  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.47 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647439  decreased coverage  0.00158876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2605  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.46 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2312  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.21 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.113933  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4535  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0469599  normal  0.805558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2470  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.3 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2437  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4757  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.37 
 
 
115 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.424428  normal  0.0249219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2603  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  29.46 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.996132  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3250  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.91 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.493991  normal  0.819791 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0033  PemK-like protein  29.35 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0906  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  26.85 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000283509  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0041  mRNA endonuclease-like protein PemK  27.66 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02589  hypothetical protein  26.85 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000056084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2926  toxin ChpA  26.85 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000398718  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2490  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.11 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2131  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  30.53 
 
 
115 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>