27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2002 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1018    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32500  hypothetical protein  44.95 
 
 		 328 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  44.44 
 
 		 606 aa  237  4e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4414  carbohydrate-binding protein  38.56 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11772  hypothetical protein  35.78 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00013722  hitchhiker  0.00000000159195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0411  hypothetical protein  33.5 
 
 		 701 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0420  hypothetical protein  33.5 
 
 		 701 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0399  hypothetical protein  33.5 
 
 		 701 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708944  normal  0.4218 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  33.43 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3407  hypothetical protein  33.62 
 
 		 438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5180  hypothetical protein  33.16 
 
 		 692 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1576  hypothetical protein  34.85 
 
 		 676 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.592889  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3396  hypothetical protein  33.55 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3459  hypothetical protein  33.55 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.972457  normal  0.141777 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1707  carbohydrate-binding protein  36.75 
 
 		 386 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2701  hypothetical protein  30.61 
 
 		 680 aa  150  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2716  hypothetical protein  30.61 
 
 		 676 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138659  normal  0.0803009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2671  hypothetical protein  30.61 
 
 		 676 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0971052  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2501  hypothetical protein  34.17 
 
 		 371 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.942803  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5522  hypothetical protein  27.25 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2970  hypothetical protein  28.14 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.751767  normal  0.167477 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2125  hypothetical protein  29.32 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5255  hypothetical protein  29.05 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.435097  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4976  hypothetical protein  29.05 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4887  hypothetical protein  29.05 
 
 		 376 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0537517  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5502  hypothetical protein  27.1 
 
 		 350 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13739  hypothetical protein  27.52 
 
 		 336 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.101062  normal  0.216027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>