15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1812 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1812  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  746    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2092  hypothetical protein  30.97 
 
 
373 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.486857  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0912  hypothetical protein  28.69 
 
 
372 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0522932  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4077  hypothetical protein  28.41 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1169  hypothetical protein  27.3 
 
 
373 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0945057 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4039  hypothetical protein  27.2 
 
 
371 aa  103  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970162  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00220  hypothetical protein  29.33 
 
 
371 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4088  hypothetical protein  24.66 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1846  putative cytoplasmic protein  22.31 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.117418  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3832  hypothetical protein  22.51 
 
 
387 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0154  hypothetical protein  22.16 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1775  hypothetical protein  22.22 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4118  hypothetical protein  26.4 
 
 
409 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0150  hypothetical protein  23.64 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000318302  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1307  hypothetical protein  24.68 
 
 
388 aa  42.7  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.323452  normal  0.304058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>