18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1696 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  39.23 
 
 		 134 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  30.43 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1423  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.46 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5171  hypothetical protein  29.27 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.182508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  31.25 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3334  hypothetical protein  27.64 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  26.15 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  22.22 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1138  limonene-12-epoxide hydrolase  26.45 
 
 		 134 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.866849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  28.68 
 
 		 359 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  23.58 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1094  hypothetical protein  23.39 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0113  ketosteroid isomerase-like protein  26.36 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  25.78 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3358  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  25 
 
 		 141 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1777  hypothetical protein  22.22 
 
 		 148 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>