17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1243 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  44.95 
 
 
243 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.19 
 
 
213 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.28 
 
 
219 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  30.62 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  35.15 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.03 
 
 
747 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.83 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
218 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.26 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  30.07 
 
 
213 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.09 
 
 
241 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  27.63 
 
 
232 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.44 
 
 
215 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  33.93 
 
 
531 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  29.29 
 
 
145 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>