46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2956 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2956  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1269  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  96.97 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1228  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  60 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0073  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  57.5 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3182  redoxin  57.14 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.838536  normal  0.0871937 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0122  redoxin  55 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000117403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1115  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1144  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0825  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  50 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.611053  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2789  Peroxiredoxin  56.1 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2927  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2145  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.459175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1194  AhpC/TSA family protein  56.25 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3716  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.55 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0540539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4710  peroxiredoxin  60.98 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2758  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1277  alkyl hydroperoxide reductase/thiol specific antioxidant/Mal allergen  54.17 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2703  redoxin  48 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3801  redoxin domain-containing protein  51.22 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.659917  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0485  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.53 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5046  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.1 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.14204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2601  anti-oxidant AhpCTSA family protein  41.67 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1208  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  54.17 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0948217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2734  peroxidase  51.11 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2778  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  50 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2391  putative bacterioferritin comigratory oxidoreductase  58.54 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245357  normal  0.154155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0757  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  55 
 
 		 147 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0269162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1796  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.54 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0307  Peroxiredoxin  52.27 
 
 		 223 aa  41.2  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_002978  WD1285  bacterioferritin comigratory protein  50 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  53.66 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1460  peroxiredoxin-like protein  46.34 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0873499  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4723  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  58.82 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0945  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.41 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0775  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.33 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0891  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.41 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0518  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  51.22 
 
 		 197 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3394  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.15 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00102224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0254  peroxidase  51.28 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5416  1-Cys peroxiredoxin  51.28 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279435  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3881  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.66 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0782  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.83 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000180139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2548  redoxin domain-containing protein  52.5 
 
 		 201 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4782  2-cys peroxiredoxin  48.84 
 
 		 48 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00178106  hitchhiker  0.00703244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0414  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  53.66 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1314  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  56.1 
 
 		 150 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>