18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1713 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1713  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2510  hypothetical protein  83.75 
 
 		 357 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2048  hypothetical protein  37.43 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.802399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1817  hypothetical protein  27.4 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2469  hypothetical protein  27.12 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.056918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1856  hypothetical protein  27.12 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1845  hypothetical protein  25.5 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.940266  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1809  hypothetical protein  25.9 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3196  hypothetical protein  28.25 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1593  hypothetical protein  24.26 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.683958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1532  hypothetical protein  23.81 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0018  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1006 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774764 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1252  hypothetical protein  26.79 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1599  hypothetical protein  24.93 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3039  hypothetical protein  35.92 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1620  hypothetical protein  25.14 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2992  hypothetical protein  26.1 
 
 		 735 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3070  hypothetical protein  25.82 
 
 		 735 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>