18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0896 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0896  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2553  hypothetical protein  67.97 
 
 
152 aa  216  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0891  type II secretory pathway pseudopilin PulG  31.88 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  41.27 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.97 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  43.64 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0897  tfp pilus assembly protein, major pilin  37.31 
 
 
118 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.768254  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  43.64 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  35.9 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.89 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55 
 
 
174 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  41.82 
 
 
152 aa  40.8  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  25.47 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  40 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  40 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  26.14 
 
 
142 aa  40.4  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  25 
 
 
291 aa  40.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  40 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>