31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0602 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0602  phage-type endonuclease  100 
 
 		 311 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2619  YqaJ  58.2 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000010002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1473  Phage-related protein endonuclease-like protein  51.14 
 
 		 306 aa  308  8e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2263  hypothetical protein  46.18 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00963472  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0938  hypothetical protein  45.95 
 
 		 303 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0866  hypothetical protein  39.05 
 
 		 374 aa  203  4e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.896574  normal  0.759302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1620  hypothetical protein  38.41 
 
 		 374 aa  198  7.999999999999999e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1345  Phage-related protein endonuclease-like protein  36.53 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000265319  decreased coverage  0.000101887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0110  hypothetical protein  37.58 
 
 		 358 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1657  hypothetical protein  37.96 
 
 		 342 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2726  hypothetical protein  36.34 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.302744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0204  GP47  36.76 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0982  hypothetical protein  37 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000285055  hitchhiker  0.0000282178 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2448  hypothetical protein  37.03 
 
 		 342 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2356  hypothetical protein  36.59 
 
 		 368 aa  185  8e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0622812  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1183  Phage-related protein endonuclease-like protein  37.27 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4743  phage-related protein endonuclease-like protein  37.27 
 
 		 334 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.231327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3684  hypothetical protein  38.03 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.429616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2495  hypothetical protein  37.06 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3739  putative phage-related protein  35.87 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00326083  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3414  Phage-related protein endonuclease-like protein  40.71 
 
 		 303 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0329559 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0602  phage-type endonuclease  33.18 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0373  Phage-related protein endonuclease-like protein  46.24 
 
 		 136 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.743719 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0099  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.344559  hitchhiker  0.000179281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4009  hypothetical protein  27.8 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0110  putative phage-type endonuclease  26.92 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.300181 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1286  hypothetical protein  29.03 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3048  phage-related protein predicted endonuclease-like protein  24.01 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00171886  normal  0.0334909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0591  hypothetical protein  23.79 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2700  Phage-related protein endonuclease-like  24.87 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3032  Exonuclease, phage-type  29.78 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.727165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>