More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0136 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  95.04 
 
 		 121 aa  224  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 121 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 121 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 121 aa  214  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  86.78 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  84.3 
 
 		 121 aa  210  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  83.47 
 
 		 121 aa  208  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  82.64 
 
 		 121 aa  196  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  82.64 
 
 		 121 aa  196  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  80.17 
 
 		 121 aa  192  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  76.86 
 
 		 121 aa  180  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 121 aa  180  7e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  76.86 
 
 		 121 aa  180  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1459  30S ribosomal protein S13  75.21 
 
 		 121 aa  179  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000394716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  76.23 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  179  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 123 aa  177  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0618  30S ribosomal protein S13  73.17 
 
 		 123 aa  177  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  176  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 121 aa  176  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  71.54 
 
 		 123 aa  176  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  71.07 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2377  30S ribosomal protein S13  70.25 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000483861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  72.13 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  70.49 
 
 		 123 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 123 aa  171  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0314  30S ribosomal protein S13  74.56 
 
 		 115 aa  171  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  9.88789e-29 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 124 aa  170  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  68.03 
 
 		 122 aa  170  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0672  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  169  1e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 125 aa  168  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  168  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  66.41 
 
 		 132 aa  167  5e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 124 aa  167  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  68.38 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 121 aa  164  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0081  30S ribosomal protein S13  65.52 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000227347  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  66.12 
 
 		 123 aa  164  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 126 aa  163  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  163  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  69.3 
 
 		 126 aa  163  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0981  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000395911  hitchhiker  0.00390271 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0447  30S ribosomal protein S13  66.38 
 
 		 118 aa  160  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000202005  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  159  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 128 aa  159  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 125 aa  159  9e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  68.14 
 
 		 114 aa  159  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0506  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00117339  normal  0.0273818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  62.3 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0511  30S ribosomal protein S13  64.66 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0430719  normal  0.0101578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3729  30S ribosomal protein S13  62.07 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00146964  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  62.93 
 
 		 118 aa  158  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 118 aa  157  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf414  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  61.21 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 124 aa  157  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 126 aa  156  9e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  62.93 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>