More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2529 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  47.82 
 
 		 699 aa  646    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  47.44 
 
 		 691 aa  648    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2529  elongation factor G  100 
 
 		 689 aa  1380    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  49.13 
 
 		 692 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  47.14 
 
 		 691 aa  650    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  49.13 
 
 		 698 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  48.61 
 
 		 692 aa  663    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  48.56 
 
 		 703 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  50.07 
 
 		 701 aa  649    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  46.53 
 
 		 692 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  47.29 
 
 		 691 aa  646    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  46.79 
 
 		 692 aa  649    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  46.82 
 
 		 692 aa  647    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  46.56 
 
 		 692 aa  642    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  46.56 
 
 		 692 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  47.28 
 
 		 689 aa  642    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  46.56 
 
 		 692 aa  643    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  47.03 
 
 		 697 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  47.9 
 
 		 694 aa  649    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  47.75 
 
 		 694 aa  649    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2171  elongation factor G  65.35 
 
 		 684 aa  899    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  50.73 
 
 		 689 aa  694    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.55 
 
 		 700 aa  648    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  47.95 
 
 		 692 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  48.41 
 
 		 702 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  49.12 
 
 		 689 aa  664    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  47.72 
 
 		 700 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  47.58 
 
 		 692 aa  643    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  48.84 
 
 		 704 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  47.21 
 
 		 692 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  46.26 
 
 		 692 aa  640    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  62.37 
 
 		 691 aa  844    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  49.78 
 
 		 692 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  48.98 
 
 		 691 aa  659    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  46.71 
 
 		 692 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  48.98 
 
 		 704 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  49.63 
 
 		 680 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  48.61 
 
 		 704 aa  641    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  49.71 
 
 		 701 aa  653    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  48.54 
 
 		 692 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  77 
 
 		 688 aa  1063    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  47.27 
 
 		 692 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  46.56 
 
 		 692 aa  642    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  47.9 
 
 		 699 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  46.92 
 
 		 691 aa  638    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  45.85 
 
 		 693 aa  642    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  47.32 
 
 		 696 aa  645    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  46.24 
 
 		 689 aa  640    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  47.67 
 
 		 699 aa  646    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  51.76 
 
 		 692 aa  710    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  46.88 
 
 		 692 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  50.36 
 
 		 697 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  49.55 
 
 		 689 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  46.84 
 
 		 691 aa  644    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  48.11 
 
 		 690 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  46.56 
 
 		 692 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  47.91 
 
 		 700 aa  636    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  50.59 
 
 		 697 aa  679    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  69.23 
 
 		 688 aa  960    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  47.4 
 
 		 700 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  47.62 
 
 		 700 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  48.54 
 
 		 692 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  48.19 
 
 		 701 aa  635    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  640    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  48.75 
 
 		 691 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  47.97 
 
 		 700 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  48.7 
 
 		 703 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  47.01 
 
 		 700 aa  638    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  49.93 
 
 		 700 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  48.38 
 
 		 697 aa  679    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  46.72 
 
 		 700 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  47.88 
 
 		 691 aa  639    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  48.98 
 
 		 691 aa  675    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  47.9 
 
 		 699 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  48.55 
 
 		 691 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  47.44 
 
 		 691 aa  649    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  50.07 
 
 		 702 aa  647    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  48.32 
 
 		 704 aa  640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  49.56 
 
 		 700 aa  651    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  49.41 
 
 		 692 aa  678    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  46.41 
 
 		 692 aa  639    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  50.44 
 
 		 697 aa  678    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  48.68 
 
 		 690 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  48.47 
 
 		 704 aa  635    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  47.73 
 
 		 692 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  48.38 
 
 		 692 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  49.27 
 
 		 704 aa  653    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  641    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  46.65 
 
 		 693 aa  645    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  48.05 
 
 		 700 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  50.29 
 
 		 697 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  46.53 
 
 		 692 aa  643    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  53.17 
 
 		 706 aa  715    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>