67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4078 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4078  Ankyrin  100 
 
 
270 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1215  Ankyrin  52.4 
 
 
276 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3036  Ankyrin  52.19 
 
 
276 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1214  Ankyrin  50.2 
 
 
276 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4265  Ankyrin  25.57 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3236  Ankyrin  25.45 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2821  Ankyrin  24.89 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4264  Ankyrin  25.45 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4263  Ankyrin  24.78 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2822  Ankyrin  24.66 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4266  Ankyrin  23.25 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2823  Ankyrin  25.45 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  27.92 
 
 
261 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6088  ankyrin  25.61 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239152  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  31.21 
 
 
431 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2435  putative lipoprotein  25.86 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.987878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  27.57 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  25.13 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  27.59 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2511  ankyrin  24.32 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  25.68 
 
 
954 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2693  ankyrin repeat-containing protein  28.74 
 
 
933 aa  51.6  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.82952  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  26.42 
 
 
1585 aa  50.4  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  27.62 
 
 
337 aa  50.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  26.72 
 
 
344 aa  49.3  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.7 
 
 
2413 aa  49.3  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  28.28 
 
 
1097 aa  49.3  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  26.16 
 
 
715 aa  48.9  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  29.49 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  29.77 
 
 
450 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0291  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  27.46 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.461089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3066  Ankyrin  35.58 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.590896  hitchhiker  0.00125449 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  24.02 
 
 
762 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  26.52 
 
 
750 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  31.34 
 
 
1101 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0819  Ankyrin  26.67 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00484639 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  29.79 
 
 
776 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  26.76 
 
 
4520 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  25.7 
 
 
1061 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2701  Ankyrin  27.27 
 
 
385 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.575669  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.44 
 
 
1402 aa  47  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  26.29 
 
 
723 aa  46.2  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.31 
 
 
870 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  29.85 
 
 
1099 aa  44.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  31.46 
 
 
790 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  27.66 
 
 
821 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  26.95 
 
 
368 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  23.53 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2373  Ankyrin  26.44 
 
 
555 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000336897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3478  ankyrin repeat-containing protein  22.83 
 
 
388 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0361  ankyrin  25 
 
 
301 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0332017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3226  ankyrin repeat-containing protein  22.83 
 
 
403 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  24.81 
 
 
737 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  27.19 
 
 
427 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  25.93 
 
 
483 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  23.29 
 
 
646 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  25.42 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  24.81 
 
 
483 aa  43.9  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  25 
 
 
479 aa  43.9  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  24.56 
 
 
494 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  26.29 
 
 
1005 aa  43.5  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0830  hypothetical protein  28.35 
 
 
307 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0248874 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  22.12 
 
 
530 aa  43.5  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.37 
 
 
464 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  26.42 
 
 
855 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  32.58 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  25.29 
 
 
321 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>