15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3187 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1074  hypothetical protein  91.94 
 
 		 397 aa  763    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.247109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  820    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2858  hypothetical protein  39.57 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.953596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0116  hypothetical protein  38.23 
 
 		 407 aa  262  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000692452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2589  hypothetical protein  37.22 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0501  hypothetical protein  36.76 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3702  hypothetical protein  36.53 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4047  hypothetical protein  35.62 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0451  hypothetical protein  35.23 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0968  hypothetical protein  33.7 
 
 		 385 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3747  hypothetical protein  29.07 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.652201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0051  hypothetical protein  27.11 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000151873  hitchhiker  0.00624496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3430  hypothetical protein  28.79 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2870  hypothetical protein  23.1 
 
 		 401 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1829  hypothetical protein  26.89 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>