34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2850 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2850  cytochrome c class I  100 
 
 		 312 aa  657    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2122  cytochrome c, class I  67.33 
 
 		 312 aa  454  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.959895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1555  hypothetical protein  33.11 
 
 		 428 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1460  hypothetical protein  33.44 
 
 		 428 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2403  hypothetical protein  31.79 
 
 		 428 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0243  hypothetical protein  32.14 
 
 		 409 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0200  cytochrome c class I  27.54 
 
 		 743 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3336  cytochrome c class I  33.7 
 
 		 117 aa  53.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0198059  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  35.16 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0910  cytochrome c class I  31.52 
 
 		 117 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.58157e-33 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  25.83 
 
 		 349 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3334  cytochrome c family protein, putative  27.47 
 
 		 104 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.115462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  26.49 
 
 		 349 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  34.41 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  25.17 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2759  cytochrome c class I  31.25 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  43.4 
 
 		 1084 aa  46.6  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2254  hypothetical protein  27.45 
 
 		 133 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1994  putative cytochrome c  29.79 
 
 		 132 aa  46.2  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0572463  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  31.52 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  33.7 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  32.61 
 
 		 345 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5240  putative cytochrome c class I protein  33.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114895  normal  0.361505 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  25.93 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>