14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5071 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5071  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  783    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.105918  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0275  hypothetical protein  61.56 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.484738  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0166  hypothetical protein  33.48 
 
 		 450 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00671267  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4409  hypothetical protein  34.92 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  30.9 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  30.3 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  28.92 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3226  hypothetical protein  29.27 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.407522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5799  hypothetical protein  34.44 
 
 		 380 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.808848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  30.99 
 
 		 505 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0789  hypothetical protein  31.68 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.236873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  30.3 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>