17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3411 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  67.69 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  66.67 
 
 
355 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  66.67 
 
 
355 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  66.67 
 
 
355 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  64.91 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  64.91 
 
 
355 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  63.16 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  63.16 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  70.59 
 
 
51 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1465  hypothetical protein  78.38 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4365  hypothetical protein  78.38 
 
 
68 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  49.18 
 
 
153 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  50 
 
 
357 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  55.32 
 
 
303 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  51.02 
 
 
214 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  75 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>