27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2629 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2629  methyltransferase type 11  100 
 
 
291 aa  577  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2846  methyltransferase type 11  62.59 
 
 
315 aa  306  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0031  hypothetical protein  64.71 
 
 
295 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4007  hypothetical protein  64.08 
 
 
115 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
225 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.27 
 
 
201 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  50.94 
 
 
658 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2184  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 
293 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 
511 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  48.94 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  47.92 
 
 
233 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
706 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 
228 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
228 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
237 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  34.78 
 
 
219 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
188 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2762  Methyltransferase type 11  32.03 
 
 
265 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  35.82 
 
 
253 aa  42.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  52.27 
 
 
221 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
201 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  27.27 
 
 
272 aa  42.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>