More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2188 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6366  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  83.98 
 
 		 387 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2188  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28760  acyl-CoA dehydrogenase  80.74 
 
 		 382 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.12851  normal  0.0971486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1029  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  76.36 
 
 		 387 aa  613  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4743  butyryl-CoA dehydrogenase  76.88 
 
 		 417 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1719  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  77.14 
 
 		 389 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13303  acyl-CoA dehydrogenase fadE25  76.88 
 
 		 389 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1058  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.29 
 
 		 386 aa  596  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.405365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4214  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  77.17 
 
 		 386 aa  597  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.234142  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1300  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  75.84 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1317  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.84 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1336  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  75.84 
 
 		 388 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4353  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  74.14 
 
 		 385 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1647  acyl-CoA dehydrogenase  72.06 
 
 		 385 aa  564  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.658516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1549  butyryl-CoA dehydrogenase  69.01 
 
 		 387 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.431805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4413  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  69.45 
 
 		 384 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4530  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  66.15 
 
 		 389 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.335652  normal  0.412983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4115  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.77 
 
 		 390 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2589  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  67.77 
 
 		 390 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000683478  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  66.23 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.189497  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0934  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  65.54 
 
 		 387 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.496704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0714  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  68.3 
 
 		 388 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.114203  normal  0.0860013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08440  acyl-CoA dehydrogenase  65.71 
 
 		 389 aa  503  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.231358  normal  0.194083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6030  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.73 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0409  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  64.77 
 
 		 406 aa  500  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1345  acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain protein  66.24 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1390  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.82 
 
 		 390 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4062  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.8 
 
 		 389 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1526  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  58.53 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.84855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3341  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.49 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3450  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  51.97 
 
 		 380 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5464  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000608426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5472  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5190  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5519  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.814074  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5025  butyryl-CoA dehydrogenase (short-chain acyl-CoA dehydrogenase)  50.26 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5041  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5586  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5434  acyl-CoA dehydrogenase  50.26 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000286159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5488  acyl-CoA dehydrogenase  50 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270181  hitchhiker  1.62736e-22 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1546  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.21 
 
 		 381 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4700  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.6 
 
 		 384 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.201387  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5139  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.47 
 
 		 379 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1881  butyryl-CoA dehydrogenase  46.72 
 
 		 379 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.593492  normal  0.222475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3862  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.63 
 
 		 379 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1371  butyryl-CoA dehydrogenase  47.76 
 
 		 389 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.183303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1232  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.33 
 
 		 381 aa  345  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0585  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.05 
 
 		 379 aa  345  8.999999999999999e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1356  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.97 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000100384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5487  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 		 381 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302943  hitchhiker  1.44799e-22 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1697  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  46.7 
 
 		 386 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0868604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2865  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.76 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5465  acyl-CoA dehydrogenase  45.45 
 
 		 381 aa  339  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000680329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5191  acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5587  acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5520  acyl-CoA dehydrogenase  45.19 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5026  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 		 376 aa  335  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5435  acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 		 376 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000529924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0402  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  44.47 
 
 		 380 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5473  acyl-CoA dehydrogenase  45.65 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1782  butyryl-CoA dehydrogenase  47.11 
 
 		 379 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.257154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5042  short-chain acyl-CoA dehydrogenase; butyryl-CoA dehydrogenase  45.38 
 
 		 376 aa  333  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2584  butyryl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2286  butyryl-CoA dehydrogenase  43.68 
 
 		 379 aa  332  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2863  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.11 
 
 		 380 aa  332  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3863  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.38 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2695  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.16 
 
 		 382 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3342  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.85 
 
 		 379 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1076  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  44.44 
 
 		 379 aa  328  7e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.228764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5140  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  45.12 
 
 		 376 aa  328  8e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06620  butyryl-CoA dehydrogenase  44.47 
 
 		 380 aa  321  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5641  Butyryl-CoA dehydrogenase  44.62 
 
 		 379 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0455  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  42.78 
 
 		 380 aa  316  4e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6291  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.01 
 
 		 379 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3576  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.44 
 
 		 380 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.39 
 
 		 642 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3281  acyl-CoA dehydrogenase-like  44.56 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3307  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.2 
 
 		 380 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3827  bytyryl-CoA dehydrogenase (short-chain-acyl-CoA dehydrogenase)  44.27 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3365  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.13 
 
 		 381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.122497 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0092  butyryl-CoA dehydrogenase  41.16 
 
 		 378 aa  309  6.999999999999999e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0136  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.89 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2439  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.16 
 
 		 380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1659  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.92 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1490  butyryl-CoA dehydrogenase  42.52 
 
 		 378 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0656  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.89 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1843  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  43.04 
 
 		 380 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1483  butyryl-CoA dehydrogenase  41.49 
 
 		 382 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3053  Acyl-CoA dehydrogenase  41.21 
 
 		 381 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.75901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.16 
 
 		 388 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  42.93 
 
 		 641 aa  302  7.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0397  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.76 
 
 		 379 aa  302  8.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.362138 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0391  acyl-CoA dehydrogenase  44.95 
 
 		 375 aa  301  9e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.31925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2832  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  41.32 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.98 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.954368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3575  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  44.18 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0583  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  43.98 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.394739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3574  putative acyl-CoA dehydrogenase  44.53 
 
 		 377 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1381  Butyryl-CoA dehydrogenase  41.67 
 
 		 379 aa  300  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33630  acyl-CoA dehydrogenase  44.66 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>