21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1617 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1617  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  309  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7231  hypothetical protein  88.24 
 
 
121 aa  212  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4878  hypothetical protein  84.48 
 
 
129 aa  202  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1535  hypothetical protein  76.07 
 
 
122 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.837882 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18100  ketosteroid isomerase-like enzyme  82.14 
 
 
126 aa  187  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.518339  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1477  hypothetical protein  80.36 
 
 
115 aa  186  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0455495  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3050  hypothetical protein  76.07 
 
 
119 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1975  hypothetical protein  64.86 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5024  hypothetical protein  59.82 
 
 
118 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1143  hypothetical protein  41.88 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3776  hypothetical protein  42.11 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1204  hypothetical protein  41.03 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.142365  normal  0.100074 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1364  hypothetical protein  41.03 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.703874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2283  hypothetical protein  42.15 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0585  hypothetical protein  65.31 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2619  hypothetical protein  33.06 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.817565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0954  hypothetical protein  35.83 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3143  hypothetical protein  35.9 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.511096  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2188  hypothetical protein  27.35 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268493  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1514  steroid delta-isomerase  45.61 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4708  hypothetical protein  31.03 
 
 
139 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>