23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0056 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  44.91 
 
 
1027 aa  745    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  100 
 
 
1035 aa  2012    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  56.77 
 
 
1042 aa  975    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  38.31 
 
 
1029 aa  439  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  34.54 
 
 
1021 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.27 
 
 
1066 aa  402  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.83 
 
 
1009 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  34.77 
 
 
1074 aa  376  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  35.27 
 
 
1031 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  35.79 
 
 
729 aa  311  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  33.08 
 
 
915 aa  304  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.37 
 
 
968 aa  158  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  27.58 
 
 
964 aa  138  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.14 
 
 
1038 aa  132  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.48 
 
 
1042 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.77 
 
 
1036 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  33.7 
 
 
373 aa  117  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.38 
 
 
1013 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.76 
 
 
757 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.88 
 
 
1148 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  22.86 
 
 
1060 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.32 
 
 
1055 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0922  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  23.79 
 
 
895 aa  44.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>