18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4076 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 355 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 355 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  91.43 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  93.94 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  88.57 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  93.94 
 
 		 51 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  90.91 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  90.91 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  80 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  80 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  66.67 
 
 		 357 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  72.41 
 
 		 214 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  60.53 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1465  hypothetical protein  78.57 
 
 		 68 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4365  hypothetical protein  78.57 
 
 		 68 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  48 
 
 		 368 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  75 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>