12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3847 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3847  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  904    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506068 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6732  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0437  polysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2389  polysaccharide biosynthesis protein  24.71 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1584  hypothetical protein  26.07 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6397  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 612 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6867  polysaccharide biosynthesis protein  25.19 
 
 		 439 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0138  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0849763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0674  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 		 413 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0215  polysaccharide biosynthesis protein  35.06 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1926  membrane protein  27.24 
 
 		 1197 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.759064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1060  hypothetical protein  25.71 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.945271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>