17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3412 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3412  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 456 aa  890    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0316076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  34.59 
 
 		 859 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 393 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 610 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.06 
 
 		 651 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.55 
 
 		 651 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 		 592 aa  47  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 571 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  20.99 
 
 		 575 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.67 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  20.99 
 
 		 575 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.49 
 
 		 613 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.62 
 
 		 588 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2193  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 648 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>