85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3222 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3222  transposase  100 
 
 		 85 aa  174  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0712504  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1959  transposase IS116/IS110/IS902  78.87 
 
 		 420 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.945198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6341  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.11 
 
 		 408 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6342  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.11 
 
 		 408 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0725  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  53.52 
 
 		 411 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4948  transposase IS111A/IS1328/IS1533  46.48 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1049  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.14 
 
 		 542 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.66 
 
 		 408 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0989  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.14 
 
 		 540 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1047  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.14 
 
 		 540 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1048  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.14 
 
 		 540 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3436  transposase IS116/IS110/IS902  47.89 
 
 		 412 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3437  transposase IS116/IS110/IS902  47.89 
 
 		 412 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.222755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4122  transposase IS116/IS110/IS902  47.89 
 
 		 412 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3130  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.48 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5208  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.06 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5136  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.06 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.06 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127954  hitchhiker  0.00882366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1319  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.06 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.622627  normal  0.467675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0957  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.06 
 
 		 423 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.29 
 
 		 435 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2090  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.07 
 
 		 378 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000104804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3127  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.48 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3050  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.166757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3328  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5410  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2919  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000420337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1178  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.28 
 
 		 407 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0543  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.66 
 
 		 402 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1960  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.85 
 
 		 411 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.261169  normal  0.0163724 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2321  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.21 
 
 		 406 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2322  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.21 
 
 		 406 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0197  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.21 
 
 		 406 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1903  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  35.21 
 
 		 406 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2125  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.25 
 
 		 412 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2366  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.25 
 
 		 412 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.587886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2235  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.25 
 
 		 444 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.25 
 
 		 412 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.03 
 
 		 414 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0000113167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0589  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.03 
 
 		 414 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3851  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.03 
 
 		 414 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.03 
 
 		 414 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1223  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  40.3 
 
 		 310 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0130  transposase IS116/IS110/IS902  47.89 
 
 		 454 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4507  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.71 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.717129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0407  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 		 420 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2265  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 		 420 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.654295  normal  0.518866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3921  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 		 420 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.174408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4655  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 		 420 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4882  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.67 
 
 		 420 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0087  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0682  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0858  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.425839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1282  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00124375  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.198929  normal  0.0124292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2232  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000585875  normal  0.443218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2973  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0717724  normal  0.0172565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4398  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 466 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14300  transposase IS116/IS110/IS902  36.92 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3263  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2972  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2709  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2432  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1265  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1142  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1110  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0550  ISAfe3, transposase  33.8 
 
 		 408 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.227474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1287  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.5 
 
 		 465 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.324635  normal  0.577676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3292  transposase  42.86 
 
 		 330 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000349541 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.235324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1407  transposase  28.57 
 
 		 414 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.31889  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0326  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.269164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1225  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3374  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.495996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4042  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4041  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.402524  normal  0.468293 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2147  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000616647 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3441  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.83256 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3370  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3403  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0158163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3378  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.195678 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3377  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.46 
 
 		 408 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.465858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>