57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3095 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 144 aa  293  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  83.92 
 
 		 148 aa  257  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  43.36 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  45.52 
 
 		 145 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  45.14 
 
 		 143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  40.69 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  43.06 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  44.14 
 
 		 145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  39.58 
 
 		 147 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  38.46 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  38.89 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  38.73 
 
 		 156 aa  104  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  39.58 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  39.31 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  38.81 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  38.81 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  38.81 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  38.36 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  34.93 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  36.3 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  34.65 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  34.51 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  34.04 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  32.39 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  29.86 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  24.26 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  27.27 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  25 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  23.53 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  23.53 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  27.78 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  26.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>