33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0997 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0997  protein of unknown function DUF861 cupin_3  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.355393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11190  predicted enzyme of the cupin superfamily  44.44 
 
 
90 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1704  protein of unknown function DUF861 cupin_3  45.35 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1631  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.19 
 
 
87 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1414  protein of unknown function DUF861, cupin_3  50.59 
 
 
89 aa  77  0.00000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000022631  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1386  cupin superfamily protein  47.89 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.101999  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0779  protein of unknown function DUF861 cupin_3  40.7 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0364385  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4308  protein of unknown function DUF861 cupin_3  50 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0121771  normal  0.0723845 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10461  hypothetical protein  45.07 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0714  protein of unknown function DUF861, cupin_3  44.58 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.729837  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0183  protein of unknown function DUF861, cupin_3  52.94 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1097  hypothetical protein  43.9 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.714468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0659  hypothetical protein  45.83 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.42337  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4246  protein of unknown function DUF861 cupin_3  48.48 
 
 
97 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9903  predicted protein  50.7 
 
 
71 aa  71.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0288299  normal  0.909152 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0959  cupin superfamily protein  43.21 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1305  protein of unknown function DUF861 cupin_3  39.76 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1616  hypothetical protein  41.98 
 
 
90 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15781  hypothetical protein  39.44 
 
 
91 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0651  hypothetical protein  39.51 
 
 
90 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1469  hypothetical protein  39.44 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.278748  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15631  hypothetical protein  38.03 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1533  protein of unknown function DUF861, cupin_3  35.37 
 
 
91 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000391778  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2357  hypothetical protein  36.36 
 
 
609 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1145  hypothetical protein  35.82 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.212798  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1808  hypothetical protein  35.82 
 
 
174 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1060  hypothetical protein  35.82 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0842  hypothetical protein  35.82 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0624  hypothetical protein  35.82 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.819765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1624  hypothetical protein  34.33 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39730  hypothetical protein  32.31 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3611  protein of unknown function DUF861 cupin_3  32.79 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106413  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4332  protein of unknown function DUF861 cupin_3  29.41 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.896834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>