42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0889 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0889  glutaredoxin 2  100 
 
 
91 aa  186  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.816837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1645  glutaredoxin 2  55.42 
 
 
89 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1700  glutaredoxin 2  52.81 
 
 
89 aa  104  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.947077  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1268  glutaredoxin 2  48.86 
 
 
95 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2559  YdfQ  40.58 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.5439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2226  thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  34.09 
 
 
108 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000281908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0503  thioredoxin domain-containing protein  28.41 
 
 
113 aa  50.4  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2111  thioredoxin, putative  39.44 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  29.11 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2062  thioredoxin domain-containing protein  31.4 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228901  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0678  thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 
119 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0500  hypothetical protein  36 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2559  hypothetical protein  31.03 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2612  hypothetical protein  31.03 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0430  hypothetical protein  36 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0688  thioredoxin domain-containing protein  28.41 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0361  thioredoxin  36 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0364  thioredoxin  36 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.968334  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0689  thioredoxin domain-containing protein  29.21 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0534025  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0342  thioredoxin-like  30.68 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000844877  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3375  thioredoxin domain-containing protein  26.97 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0578  thioredoxin domain-containing protein  26.97 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0452  hypothetical protein  34.67 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0707435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0387  hypothetical protein  34.67 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.910777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0373  hypothetical protein  34.67 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  32.93 
 
 
272 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  32.93 
 
 
272 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0368  hypothetical protein  34.67 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2310  thioredoxin  36.76 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0316182  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4872  hypothetical protein  34.67 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1211  hypothetical protein  29.76 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0239  thioredoxin  28.95 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214788  normal  0.233282 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0499  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4016  thioredoxin domain protein  32.43 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.698342  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0658  thioredoxin domain-containing protein  26.14 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  26.44 
 
 
301 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1648  thioredoxin domain-containing protein  25.61 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0259266  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0326  Thioredoxin domain protein  30.43 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25 
 
 
330 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  25.32 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1133  thioredoxin  28.57 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.114517  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01872  thioredoxin  27.4 
 
 
285 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>