18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0670 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  100 
 
 		 320 aa  634    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1151  DNA polymerase III, delta  37.5 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0743  DNA polymerase III, delta subunit  34.81 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0767  DNA polymerase III, delta subunit  34.81 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0868  DNA polymerase III delta  27.16 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  23.73 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  23.99 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  21.55 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  21.89 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  18.86 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  24.38 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  21.76 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  22.53 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  22.85 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  19.93 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  22.66 
 
 		 338 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0072  DNA polymerase III subunit delta  21.43 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>