46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4481 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  453  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  54.42 
 
 
216 aa  239  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  44.94 
 
 
180 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  40.66 
 
 
182 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  41.14 
 
 
179 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  42.29 
 
 
176 aa  154  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  38.33 
 
 
181 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  34.68 
 
 
191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  35.26 
 
 
191 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  36.52 
 
 
195 aa  124  7e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  36.42 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  34.1 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  33.67 
 
 
209 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  32.02 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  31.84 
 
 
191 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  28.11 
 
 
200 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  27.41 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  27.27 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  26.97 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  24.87 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  25.38 
 
 
222 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  27.68 
 
 
191 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  28.81 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  24.59 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  29.07 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  25 
 
 
193 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  29.61 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  27.32 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  23.53 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  23.53 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  23.53 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  23.53 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  26.32 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  25.63 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  23.04 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  23.53 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  23.53 
 
 
198 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  25.5 
 
 
198 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0316  hypothetical protein  23.68 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  33.98 
 
 
295 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  25.31 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  23.48 
 
 
207 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  23.08 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07484  Uncharacterized protein AN7484 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW46]  23.03 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2388  fibronectin, type III domain-containing protein  25 
 
 
810 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.670329  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3388  hypothetical protein  52.78 
 
 
48 aa  42.4  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.316848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>