17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0213 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  54.41 
 
 		 257 aa  249  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  50.58 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  37.44 
 
 		 233 aa  132  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.82 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  33.64 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  32.09 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  42.5 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.67 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  31.96 
 
 		 208 aa  92.4  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  28.16 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  28.83 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1313  hypothetical protein  25.14 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14900  hypothetical protein  25.14 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1126  TPR domain-containing protein  31.36 
 
 		 246 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>